黄连秧苗每年有3个时期可以移栽。第一个时期是在2~3月雪化后，黄连新叶还未长出前，栽后成活率高，长新根、发新叶快，生长良好，入伏后死苗少，是比较好的移栽时期。第二个时期是在5~6月，此时黄连新叶已经长成，秧苗较大，栽后成活率高，生长亦好，但不宜迟至7月，因7月气温高，移栽后死苗多，生长也差。第三个时期是在9~10月，栽后不久即进入霜期，根未扎稳，就遇冬季严寒，影响成活，只有在低海拔温暖地区，才可在此时移栽。
黄连种子属低温型，且休眠期较长，达9个月以上。需要经过一个低温阶段才能打破其休眠而发芽。同时种子一经干燥，就丧失发芽能力。因此，必须进行湿砂层积处理，置于低温条件下贮藏，才能完成胚后熟阶段。如先将即将开裂的果实连果柄一同剪下，置室内通风阴凉处摊放后熟2~3天。待蓇葖果开裂后拍打出种子，簸去杂质及扬去瘪籽。然后，将种子与3份湿润的细砂土混拌均匀，装入木箱，可置山洞内贮藏。若少量种子，可趁鲜放入冰箱内，在0～6℃低温下，贮藏180天，其发芽率可达90％以上。
采用轮作的种植方式，可与禾本科植物轮作，不宜和玄参和芍药等药材轮作，在发病时，可用石灰水浇灌或退菌特喷洒防治，对于病株要及时拔除带出田间，并对病穴做好消毒工作。
1、清热解毒：黄连在中医里配以其他辅助药物既适用于湿热证，也适用于火热证，黄连苦寒，泻火解毒功效很强，凡是湿热阻滞证，温病高热，烦躁不安等都可使用，治疗湿热常配以半夏，瓜萎，等，治疗火热常配以朱砂、地黄等。2、抑菌：黄连对金葡、霍乱弧菌、乙型链球菌作用较强，对大肠杆菌、伤寒杆菌作用较弱。3、降血糖：黄连中的黄连素对血糖的调控与药物的计量和给药的方式有关，在治
在种植时要注意地下害虫，减少发病几率，发病时及时拔除病株，并在病穴内撒施石灰粉消毒，以免病害蔓延，在发病初期可退菌特、克瘟散防治。
合理密植，调整植株间的通风透光性，在冬季时全面清园，将枯枝残叶集中烧毁或深埋，可在发病时喷洒石硫合剂，每隔一周喷一次，连续2-3次。
