黄柏，又名黄檗、檗皮，为芸香科植物黄柏或黄皮树的树皮，始载于《神农本草经》，为清热解毒的常用中药。其性寒，味苦，具有清热燥湿、泄火除蒸、解毒疗疮的功效，常用于治疗湿热泻痢、黄疸、赤白带下、淋浊、梦遗、骨蒸劳热、盗汗、目赤肿痛、口舌生疮、疮疡肿毒、湿疹瘙痒等症。目前，市场上有以旋花科植物番薯的块根加工而冒充黄柏，要注意。
黄连，毛茛科植物黄连或同属植物的根茎，是临床最常用的清热类药物之一。性寒，味苦。归心、脾、胃、肝、胆、大肠经。功效清热燥湿、泻火解毒。对治疗湿热痞满、呕吐吞酸、泻痢、黄疸、高热神昏、心火亢盛、血热吐衄、目赤、牙痛、消渴等病症有良好疗效。外治疮痈疔肿，湿疹、湿疮、耳道流脓等皆有很好疗效。《本草正义》有“凡药能去湿者必増热，能除热者必不能去湿。惟黄连能以苦燥湿，以寒除热，一举两得，莫神于此”。现代研究黄连有解热、抗炎、降血糖、利胆、保肝、抗溃疡、抗腹泻、抗肿瘤等作用。《珍珠囊》曰：“黄连其用有六：泻心脏火，一也；去中焦湿热，二也；诸疮必用，三也；去风湿，四也；治赤眼暴发，五也；止中部见血，六也。”
现代药理研究表明，黄柏与黄连同样含有较多的小檗碱，对金黄色葡萄球菌、肺炎球菌、白喉杆菌、草绿色链球菌、痢疾杆菌等均有抗菌作用，其煎剂对若干常见的致病性真菌有不同程度的抑制作用，还有抑制中枢神经系统、保护血小板、降低血压等作用。
黄芩，又名山茶根、空心草、黄金茶，为唇形科植物黄芩的根。黄芩具有清热燥湿、泻火解毒等功效。以上所说过的，黄连更偏于入心经，泻心火，并治不寐、心烦及上腹部不适感等涉及神志方面的病状；黄芩更偏于入肺经，长于清泄肺热，如疗痰热咳嗽等疾，以治气分之热为专功。并且还是止血良药。
总之，黄连与黄芩的异同点在于：黄连偏于入心，长于清火解毒，性燥，为心胃之剂，主治心中烦，兼治心下痞，下利，能调胃厚肠，治湿阻生热，止消渴，解巴豆毒，擅除水火相乱之病及蔓延淹久之证。黄芩则长于清肺热，其性虽寒而不燥、能治热阴生湿，主治烦热而出血者，治气热攻血之出血证及小腹绞痛或小儿腹痛，能安胎及治烫伤火疡等。
黄连与黄芩，性相近而又各有专长，故二药配伍则更能发挥协同作用，而清化湿热之效益显。例如《金匮要略》中“泻心汤”一方，即由大黄、黄芩、黄连三药组成。
黄柏、黄连、黄芩有什么区别？
我从植物形态学的角度回答吧。
这三种植物是不同科的，在外部形态差别是很大的。黄柏是木本植物（大树），黄连和黄芩是草本植物。
一，黄柏：它的正式中名叫黄檗，是芸香科黄檗属植物，别名还有黄菠萝树、黄檗木、元柏等，分布在我国东北、华北、河南、安徽等地，常生长在山地杂木林中、河沟沿岸。
它的外形特点：树高二十公尺左右，树冠宽阔，大树的树皮木栓层厚，树皮灰色或灰褐色，不整齐网状开裂，内皮薄，鲜黄色，
味道苦，也是黄柏名称的来历。单数羽状复叶有小叶五到十三片，小叶片纸质，卵状披针形或卵形，长十公分左右，叶边有细锯齿。花序顶生，花瓣紫绿色，五六月开花。果实圆球形，直径一公分，蓝黑色，九十月份果实成熟。
黄柏的主要用途：第一，树皮内层炮制后入药，称黄檗，有清热解毒、泻火燥湿作用。第二，它的木材坚硬，边材浅黄色，心材黄褐色，可制作家具、胶合板、装饰等用。第三，它的木栓层是制作软木塞的材料；种子榨油工业用。
二，黄连：黄连是分布在我国陕西、四川、贵州湖南、湖北等地的一种多年生草本，野生的常生长在山地林下、山沟的阴湿处，有部分栽培。它的别名有川连、鸡爪连等，是毛茛科黄连属植物。
它的外形特点：它的根状茎黄色，常分叉，有许多须根；叶全部是基生叶，叶柄长十公分左右，叶片稍革质，卵状三角形，宽十公分，三全裂，中间的裂片卵状菱形，长六公分左右[8u58药材网www.8u58.com]，有三到五对羽状深裂。
花葶一二个，高二十公分左右，顶端有三到八朵花，萼片五个，花瓣状，黄绿色，长一公分左右；花瓣细小，条形或条状披针形，长六毫米左右；雄蕊二十个。二三月开花。蓇葖果长六毫米左右，四到六月结果。
黄连的用途：它的根状茎是著名中药“黄连”，含有小檗碱、黄连碱等生物碱，可治疗结膜炎、痢疾、吐血等疾病。
三，黄芩：黄芩是分布在我国东北、华北、陕西、甘肃及以南少部分省区的一种多年生草本，野生的常生长在向阳的山坡草地、撂荒地上，有部分栽培。它的别名有香水水草等，是唇形科黄芩属植物。
它的外形特点：茎干伏地或上长，高三十到一百公分，基部茎稍四棱形，绿色或带紫色，从基本就分叉；根茎肥厚，肉质，粗二公分，有分叉。叶纸质，披针形或条状披针形，长三公分左右，叶边全缘，表面浅绿色，背面有毛和腺点。总状花序顶生，常再组成圆锥花序，花冠二唇形，紫色、紫红色或蓝色，七八月开花。
小坚果卵状球形，长一毫米左右，黑褐色，有瘤体，八九月果实成熟。
它的主要用途：根茎可入药，有清凉、解热、消炎等作用。
中药三黄即“黄芩、黄连、黄柏”，对应治疗人体“上、中、下”三焦病症。
传统中医的辩证施治，三焦有多种分法学派，有人主张以脏腑为主区分三焦，也有人主张以部位区分。黄芩、黄连、黄柏味苦，功效以清热、解毒为主，黄芩又分青芩和枯芩（生长年代不同），黄连以鸡爪连为主。功效类似于西药的“消炎”，而归经有所不同。比如黄芹入上焦肺经，黄连入胃肠，黄柏多入肾膀胱经等。
黄芩、黄连、黄柏是三味常用的中药材，同是具备苦寒的性味，因此都以清热泻火解毒的功效著称，三者简称“三黄”。
那么，这三种中药有什么相同之处和不同之处呢？下面先来简要的介绍一下这三种中药材。
黄芩的功效应用
黄芩，又称为山茶根、土金茶根。于唇形科植物黄芩的干燥根。
其药性苦、寒。归肺、胆、脾、大肠、小肠经。具有清热燥湿，泻火解毒，止血，安胎的功效。在临床上常应用于治疗湿温暑湿、胸闷呕恶、湿热痞满、泻痢、黄疸、肺热咳嗽、高热烦渴、痈肿疮毒、血热出血、胎热胎动不安等症。
黄连的功效应用
黄连，又称为味连、川连、鸡爪连。
其于毛茛科植物黄连、三角叶黄连或云连的干燥根茎。其药性苦、寒。归心、脾、胃、肝、胆、大肠经。具有清热燥湿，泻火解毒的功效。在临床上常用于治疗湿热痞满、呕吐、泻痢、高热神昏、心火亢盛、心烦不眠、血热吐衄、胃热呕吐吞酸、消渴、胃火牙痛、口舌生疮、目赤肿痛、耳道流脓等症。
黄柏的功效应用
黄柏又称为川黄柏，于芸香科植物黄皮树或黄檗的干燥树皮。
其药性苦、寒。归肾、膀胱经。具有清热燥湿，泻火解毒，除骨蒸的功效。在临床上可用于治疗湿热泻痢，黄疸尿赤，带下阴痒，热淋涩痛，骨蒸痨热，盗汗，遗精，疮疡肿毒，湿疹湿疮等症。
三者的区别
黄芩、黄连、黄柏这三味药其相同点
三味药均性苦、味寒，均以清热燥湿、泻火解毒见长，主治湿热为患所致多种病症，如湿温、黄疸、泻痢、痢疾等。均可用于热毒内盛，壮热口渴，疮疡肿毒。诸如此证类的，三药合用，必有良好的疗效。
黄芩、黄连、黄柏这三味药的不同点
在上，均于不同科属的植物。
在归经上，黄芩、黄连均归脾、胆、大肠经，而黄柏却不同，黄柏归于肾、膀胱经，主下焦。再之，黄芩善走上，清肺火，主肺热咳嗽为特长，并有清热安胎之功，可治疗胎动不安；黄连喜行中，偏于清心胃，主胃热呕吐、心火亢盛，心烦不寐效果甚佳，对于胃热烦渴，消谷善饥多用之。黄柏性趋下，善清肾火，退虚热，治疗骨蒸潮热、梦多遗精有神功。
除此之外，黄柏还可用于治疗湿热带下、阴肿阴痒之症。总之，黄芩偏治上、黄连偏治中、黄柏偏治下是其最显著的不同点。
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清三焦热毒，但伤肾阳。
三药均为苦味，各自归经不同，其治病救人的范围也不同！其成份各有偏颇
