砂仁应贮于密闭容器内置阴凉干燥处，忌日晒，防止散粒、走失香气及走油。在保存得当的条件下，砂仁可以存放一年。由于砂仁具有挥发油，若是存放时间过长，挥发油会减少，药效也就降低了。所以不建议使用存放时间过久的砂仁。
砂仁煮多少时间最好？砂仁要在其他药物快要煎好时，再将要煎的药物投入，煎5～10分钟即可。砂仁中的主要成份是挥发油，是一类具有治疗作用的活性成份，比水轻，对温度比较敏感，高温其挥发油易挥发或被坏，为了保证治疗效果，所以要后下。
砂仁花期在4-6月，分三个阶段：初花期约5-10天，开花占总花数10%-20%；盛花期约15-20天，开花占总花数60%-80%，末花期约5--10天，开花占总花数的10%-20%。人工授粉最佳时期是盛花期，最佳时间是早上8～10时，即花药开裂撒粉最多时进行。阴天温度低，花粉开裂撒粉时间推迟，授粉时间也相应推迟，具体情况，可灵活掌握。末花期开花数量减少，气温较高，传粉昆虫活动较频繁，砂仁自然结实率较高，一般不搞人工授粉。不论采用那种方法授粉，都要掌握技术，严肃认真，一丝不苟，轻手轻脚，才能达到目的，应尽量避免踩伤匍匐茎和折伤幼笋。
一般建议砂仁每天吃不超过20克，砂仁是很好的天然肠胃调理药，但是服用砂仁过量反而可能导致消化不良，上火、口干舌燥、大便秘结等等。
砂仁可以直接泡水喝，如果有脾胃虚寒、湿气困阻中焦，出现浑身困重、腹胀或腹部冷痛、恶心欲呕、舌苔白腻等症状时，可以用砂仁3～6克，开水冲泡喝来治疗，每天1剂。
