赤芍商品以质糯、条粗大均匀、外皮易脱落、菊花心明显、粉性强(即“糟皮粉碴”)、不空心者为佳；而质坚皮紧，空心者为次。内蒙所产“多伦赤芍”为上品，东北及华北所产均不及之。从来源上看，来源于野生芍药者优于川赤芍。
赤芍刺锈病5月下旬开花后发生，7-8月发病严重。防治方法：种植地远离松柏类植物；冬季清除残留病株，集中烧毁或沤肥；发病初期喷20％萎锈灵可湿性粉剂500倍液或 0.3-0.4波美度石硫合剂。
赤芍褐斑病主要为害叶片，也侵染枝条、花和果壳等部位。防治方法：在展叶之后、开花之前，喷洒50％多菌灵可湿性粉剂1000倍液；落花后可交替喷洒65％代森锰锌可湿性粉剂500倍液，及1％波尔多液和0.1％多菌灵，7-10天喷1次，遇雨后重喷。
赤芍灰霉病又名花腐病，为害茎、叶、花部。阴雨连绵，湿度较大时，易发病，6-7月发病较重。防治方法：冬季清除病株残枝枯叶，集中烧毁；实行轮作；及时排水；发病初期，喷1:1:100的波尔多液，每隔7-10天喷1次。
