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经过初加工的白芷用麻袋包装，包件45千克。应贮存于阴凉干燥处，温度不超过30℃，相对湿度70%-75%，商品安全水分12%-14%。本品因含淀粉及挥发油，极易虫蛀、发霉及变色。为害的仓虫有烟草甲、药材甲、米扁虫、咖啡豆象、日本蛛甲、锯谷盗、赤拟谷盗等。如被虫蛀，其根条有明显蛀孔。根条头尾部易发霉，可见明显霉斑。
滋阴清热凉血，发表透疹解毒，健脾化痰排脓。可以治疗咽炎、丹毒、痤疮等外科诸疾。
白芷种子一般在7月份采收， 在种皮呈黄绿色时进行，此时种子的成熟度较好，不老也不嫩。采种时注意选取一级侧枝上结的种子，依成熟度分批剪下种穗，扎成小捆，挂于阴凉通风处(种子怕雨淋、日晒、烟熏)，在播种之前再从小穗上把种子抖落。也有的阴干后即搓下种子，贮于布袋中，放通风干燥处存放。白芷种子不宜久藏，隔年陈种易丧失发芽力。
白芷属伞形科中药材，在选择除草剂的时候一定要注意其安全性。由于白芷的发芽比较早，在苗后除草时要注意等杂草2-4叶期喷施除草剂，可以选择精喹禾灵或者扑草净，但一定要根据苗情的大小来正确使用用量，或者为了预防药害最好可以配合除草安全添加剂一起使用安全性更高。
白芷不但能与1～2年生牡丹、白芍、太子参、旱半夏套种，还可与蔬菜间作，实行药菜间作。这是利用不同作物的生物学特性达到充分利用地力和阳光，药菜互补的原则，解决种植药、菜争地的矛盾，增加单位面积的产值。
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